تهدف كلية الصيدلة جامعة الأسماعيلية الجديدة الأهلية إلى تخريج طلاب ذوى قدرة تنافسية عالية على المستوى المحلى و الإقليميى و الدولي وذلك بأن توفر لطلابها تعليما صيدليا متميزا ومستمرا من خلال تقديم برامج أكاديمية و مهنية متطورة، كما تهدف إلى المساهمة في تنمية المجتمع المحلى والإقليمى من خلال مواكبة منظومة البحث العلمى بالكلية لمتطلبات مؤسسات العمل الصيدلي والصناعات الدوائية ومراكز خدمات الرعاية الصحية المختلفة. وتهتم الكلية بترسيخ مبادئ وآداب وأخلاقيات مهنة الصيدلة في خريجيها وتشجيع التفاعل الإيجابى بينهم وبين البيئة المحيطة والتأكيد على أهمية التعليم المستمر.

تسعى كلية الصيدلة - جامعة الأسماعيلية الجديدة الأهلية لأن تكون إحدى الكليات الرائدة في مجال الصيدلة على المستوى المحلى والإقليمي والعالمي وأن تحظى بقدرة تنافسية من حيث جودة التعليم والأبحاث العلمية وخدمة المجتمع المدني.